כאשר קהילה מתחילה בתהליך בנייתו של ארון קודש היא מצפה שבסיומו היא תקבל את הדבר שבו היא רוצה. למרבה הצער היו כבר מקרים שבהם בסוף התהליך ארון קודש חדש היה בנוי אבל הקהילה עצמה הייתה הרוסה. ילמד הציבור וידע וישמור על עצמו מתוצאות לא רצויות שכאלה.
קהילה יכולה להינזק בכמה וכמה דרכים במידה והתהליך של בניית ארון קודש נעשה בצורה מוטעית. הנזק הראשוני – אם כי לא החמור מכל הנזקים האפשריים – הוא נזק כספי. תכנון לא נכון של הבנייה וביצוע לא מקצועי עלולים לגרום להוצאות לא צפויות לקהילה וחריגה מהתקציב שיש לה. קהילות נכנסו למשבר כלכלי בעקבות תכנון פיננסי לקוי של תהליך הבנייה. כאשר התברר שהקהילה איננה יכולה לעמוד בתקציב שנקבע עקב ציפיות מוגזמות או כאשר נגרמו הוצאות חריגות במהלך הבנייה. פנייה לבעל מקצוע לא אמין יכולה להסתיים באסון כלכלי במידה והוא מבצע עבודה גרועה או דורש עוד ועוד כספים מעבר למה שנקבע מראש. תכנון פיננסי הוא הכרחי לפני שניגשים לבניה של ארון קודש אך לעיתים גם התכנון הטוב ביותר נתקל במכשולים בלתי צפויים. קהילות נוהגות בחוכמה כאשר הן משריינות סכום כסף נוסף למקרי חירום ולמשברים בלתי צפויים.
נזק כספי איננו עניין נעים ולעיתים הוא עלול להיות חמור מאד ובעל השלכות קשות. אך ישנם נזקים קשים יותר מהנזק הכלכלי. קהילות שנכנסו לתהליך של בניית ארון קודש גילו תוך כדי התהליך שהקהילה עצמה נקרעת מבפנים בגלל מחלוקות מרות על התהליך, על התכנון ועל הביצוע. קהילות התפלגו מסביב לשאלת העיצוב של הארון ולעיתים חוסר ההסכמה הוביל למשברים קשים. ישנם גם מקרים שחלקים מהקהילה מרגישים שהם נדחקים החוצה מתהליך קבלת ההחלטות ומתהליך הבניה עצמו. כאשר כמה מחברי הקהילה משתלטים על הבנייה של ארון קודש ולא משכילים לשתף את שאר המתפללים בתהליך הם עלולים לגלות שהם הצליחו לבנות ארון יפה ומרשים אך נותרו ללא קהילה.
ישנן קהילות שמצליחות לנהל את תהליך קבלת ההחלטות ללא מריבות ומתוך הסכמה כללית. עם זאת, ברוב המקרים אין הסכמה כללית ובכל חבורה יש כמה דעות, כמיטב המסורת היהודית. אין צורך להירתע מויכוחים ומחוסר הסכמה. זהו תהליך טבעי שקיים בכל מסגרת: חוסר הסכמה שצריך לגשר עליה. החוכמה איננה להימנע מויכוחים כאשר בונים ארון קודש; החוכמה היא לדעת להגיע להסכמה למרות הויכוחים ולשמור על שלמות הקהילה גם כאשר מתגלעים חילוקי דעות, עמוקים ככל שיהיו. למעשה, הימנעות מליבון של בעיות עלולה להוביל בטווח הארוך למשבר גדול יותר. דווקא על-ידי אוורור הנושאים הנתונים במחלוקת אפשר לשמר את החיים הקהילתיים ולשמור על דינאמיקה נכונה של קבלת החלטות. את הדיון יש לנהל בצורה נכונה ואין לנסות ולהתחמק מהדיון על נושאים טעונים וקשים.
בנייה נכונה של ארון קודש יכולה לסייע לחיים הקהילתיים ולהזריק דם חדש ורוח חדשה בתוך הקהילה. ניהול לא נכון ולא מוצלח של תהליך הבנייה עשוי לגרום לתוצאה ההפוכה: הרס הקהילה ויצירת משבר חריף שעליו יהיה קשה להתגבר. במקרים מסוימים אולי מוטב לקהילה לוותר על בניית ארון קודש חדש אם המחיר הוא ההרס של הקהילה.